Genetika celiakie detekcia asociovaných



Similar documents









Client URL. List of object servers that contain object


Universitat Autònoma de Barcelona







Bud row 1. Chips row 2. Coors. Bud. row 3 Milk. Chips. Cheesies. Coors row 4 Cheesies. Diapers. Milk. Diapers






FRAME. ... Data Slot S. Data Slot 1 Data Slot 2 C T S R T S. No. of Simultaneous Users. User 1 User 2 User 3. User U. No.



universe nonself self detection system false negatives false positives

Sliding Window ... Basic Window S[0] S[k 1] S[k] Digests Digests Digests

Author manuscript, published in "1st International IBM Cloud Academy Conference - ICA CON 2012 (2012)" hal , version 1-20 Apr 2012


(a) Hidden Terminal Problem. (b) Direct Interference. (c) Self Interference

application require ment? reliability read/write caching disk



(a) Original Images. (b) Stitched Image

Application. handle layer. access layer. reference layer. transport layer. ServerImplementation. Stub. Skeleton. ClientReference.


Primitives. Ad Hoc Network. (a) User Applications Distributed Primitives. Routing Protocol. Ad Hoc Network. (b)




autocorrelation analysis




Downloaded from SPIE Digital Library on 29 Aug 2011 to Terms of Use:

In Proceedings of the 1999 USENIX Symposium on Internet Technologies and Systems (USITS 99) Boulder, Colorado, October 1999

PROCESSOR IS OCCUPIED BY T i

PROTOCOLS FOR SECURE REMOTE DATABASE ACCESS WITH APPROXIMATE MATCHING

hospital physician(2)... disease(4) treat(2) W305(2) leukemia(3) leukemia(2) cancer

TheHow and Why of Having a Successful Home Office System

Applications. Decode/ Encode ... Meta- Data. Data. Shares. Multi-read/ Multi-write. Intermediary Software ... Storage Nodes

Chen Ding Yutao Zhong Computer Science Department University of Rochester Rochester, New York U.S.A.

HowPros and Cons of Owning a Home-Based Business

Archiving Scientific Data


Optimal Crawling Strategies for Web Search Engines

Real Business Cycles with Disequilibrium in the Labor Market: A Comparison of the U.S. and German Economies


} diff. } make. fetch. diff. (a) Standard LRC. (c) Home-based LRC. (b) AURC. Node 0 Node 1 Node 2 (home) Node 0 Node 1 Node 2 (home) Compute

Best Place to Find Information For a Wedding?

Resource Management for Scalable Disconnected Access to Web Services

drop probability maxp

How to create OpenDocument URL s with SAP BusinessObjects BI 4.0

HTML Codes - Characters and symbols

é é ä ä é ö é é ò é ó é Ü ä Ü ä ä

The ASCII Character Set

Push-communities. Pull-communities. Wrapped Services processors hardwarecircuits peripherals PCshopping

An Investigation of Geographic Mapping Techniques for Internet Hosts

Finding Near Rank Deficiency in Matrix Products

Open Programmable Architecture for Java-enabled Network Devices

P1 P2 P3. Home (p) 1. Diff (p) 2. Invalidation (p) 3. Page Request (p) 4. Page Response (p)

gloser og kommentarer til Macbeth ( sidetal henviser til "Illustrated Shakespeare") GS 96

ASCII control characters (character code 0-31)

desired behaviour (global constraints) composite system putative behaviour: putative agents, actions, etc.

Windows - Alt Key Numeric Codes

Working Paper Simulating Tail Probabilities in GI/GI.1 Queues and Insurance Risk Processes with Subexponentail Distributions

Latin Alphabet special characters in Microsoft Word Article by: Stélios C. Alvarez 08

Chart of ASCII Codes for SEVIS Name Fields

Transcription:

! Genetika celiakie detekcia asociovaných antigénov metódou microarray Elena Tibenská, Simona Duranková, Barbora Onderová Medirex, Bratislava 11.-13.6.2014

a i c n e l a v r e k o s y Celiakálna choroba (gluténová/ glutén- senzitívna enteropatia, celiakálna sprue) Øautoimunitné ochorenie postihujúce geneticky predisponovaných jedincov, spôsobené patologickou reakciou organizmu na prítomnosť lepku (komplex bielkovín v povrchovej časti obilných zŕn) v strave, na základe ktorej dochádza k poškodeniu sliznice tenkého čreva v p á ko syvøaicnelav eráp SR: predpokladaná 1:250 diagnostikovaná (január 2008) 1:677 vysoký počet nediagnostikovaných prípadov - vysoký výskyt tzv. mimočrevných foriem- najmä dospelí diagnostické oneskorenie 7 rokov Fasano, et al. Arch Intern Med 2003;163:286-92 Ciclitira PJ. Nature Clinical Practice Gastroenterology & Hepatology 2007 (4);9:483

C Celiakia - mimočrevné príznaky lkové: oneskorený rast u detí, váhový úbytok, celková únava Kožné: herpetiformná dermatitída, folikulárna keratóza, pigmentácie Kostrovosvalové: osteoporóza, osteopénia, fraktúry, bolesti kostí a svalov, defekty zubnej skloviny, myopatie, tetania, artritídy Neurologické: ataxia, periférna polyneuropatia, epilepsia, šeroslepota Psychiatrické: anxieta, depresia, iritabilita, poruchy pozornosti Hematologické: anémia nejasnej etiológie (nedostatok Fe a k. listovej), trombocytóza, atrofia sleziny Reprodukčný systém: infertilita a poruchy reprodukcie u žien i mužov, opakované aborty Laboratórne nálezy: nízke hladiny sérového Fe, Ca a výrazné izolované zvýšenie aminotransferáz (v typickom prípade AST < ALT), ev. zníženie ALP, predĺžený protrombínový čas

G Celiakálny ľadovec ézie ká predispozícia: - DQ2, DQ8 Pozitívna sérologia

H # " % $ #" C Genetika celiakie üfamiliárny výskyt (10-12%) ü výskyt u jednovaječných dvojčiat (83-86%) oproti dvojvaječným (11%) ü prvostupňoví príbuzní - prevalencia - 10% üdruhostupňoví - 2%???? + ü polyvalentná dedičnosť ü silná HLA asociácia

& ' J Genetika celiakie *)(Solid: Nature Immunology:2009,9:858-870

Genetika celiakie +DQ2-90-95% pacientov s celiakiou ü DQ8-8-10% pacientov ü DQ2/DQ8 negatívna CD veľmi zriedkavá (vylúčenie CD s 99% pravdepodobnosťou),dq2/dq8 positivita! CD ü bežná populácia: DQ2 ~ 30% ü DQ8 ~ 10% ü HLA DQ2 a/alebo DQ8 positivita HLA haplotypu nevyhnutná, ale nie postačujúca podmienka CD Koning et al:bpr Clin Gastro, 2005, 19:373-387

Genetika celiakie DQA1 / DQB1 alel Megiorni and Pizzuti Journal of Biomedical Science 2012, 19:88

- D 1. 0/ - D :9 8 :99 7 6 5 4 3 x Genetika celiakie HLA-DQ status a riziko Celiakie 2Very high DQ2.5 (with a double dose of DQB1*02) DQ8 DQ2.5 (with a single dose of DQB1*02) DQ2.x (with a double dose of DQB1*02) DQ2.x (with a single dose of DQB1*02) DQX.5 DQX.x Very high High High High Low Extremely low Extremely low ;different from *05. X = DQB1 alleles different from *02 and *03:02 Megiorni and Pizzuti Journal of Biomedical Science 2012, 19:88

= < = < A @? = < Genetika celiakie ü ü ü >-DQ2 = HLA-DQ2.5? >-DQ2 haplotypy DQ2.5 - DQB1*02+DQA1*05 A B- DQB1*02+DQA1*02 >-DQ 2.2 hrá úlohu pri rozvoji celiakie HLA typ Retrospektívna štúdia (n=70) Prospektívna štúdia (n=85) Spolu (n=155) HLA-DQ2.5 63 (90.0%) 76 (89.4%) 139 (89.7%) HLA-DQ8 2 ( 2.9%) 5 ( 5.9%) 7 ( 4.5%) HLA-DQ2.2 5 ( 7.1%) 4 ( 4.7%) 9 ( 5.8%) Mubarak et all: JPGN 2013 Apr;56(4):428-30

\ E g UZ W YX Q P W Q F t g U V Pt Q R S q P m uqp j M N O d f h Tw I K` t _^ Q R S q P m uqp j M N O d f h Lb I K` t _^ ~ } z zz { Diagnostický algoritmus pri podozrení na CD (podľa ESPGHAN, 2011) ]mptomatickí pacienti (deti/adolescenti) s predpokladanou CD (gastrointestinálne príznaky, rastová retardácia, osteoporóza, anémia,..) Fti-tTG (IgA) + celkové IgA1 pozit negat CD vylúčená O [erenie: IgA deficiencia? Liečba? Vek < 2 roky? Symptómy? GFD? Asociované ochorenia? 2 & HLA DQ2/DQ8 2 Testy nedostupné Biopsia tenkého čreva EMA - HLA - EMA + HLA - EMA + HLA + EMA - HLA + Marsh 2-3 Marsh 0-1? overiť falošne pozit ttg? falošne negat HLA? liakálna choroba potvrdená D falošne negat. biopsia? falošne pozit. serologia? 1 (IgA def.- ttg IgG), 2 nová vzorka

Ž Diagnostický algoritmus pri podozrení na CD (podľa ESPGHAN, 2011) ymptomatickí pacienti s genetickým rizikom CD (prvostupňoví príbuzní, DM I.typu, Downov syndróm,...) ƒ DQ2/DQ8 ˆ -ttg (IgA) + celkové IgA1 pozit negat riziko CD vylúčené pozit. ttg > 3x ref.h. Biopsia tenkého čreva Marsh 0-1 pozit. ttg < 3x ref.h. Marsh 2-3 EMA negat. EMA + EMA - CD vylúčená? overiť o? Œ Š? f l.negat.testov? IgA deficiencia? Vek < 2 roky? GFD? Opakované sledovanie/testovanie podľa potreby? overiť? falošne pozit ttg? Opakované sledovanie/testovanie podľa potreby liakálna choroba potvrdená falošne negat. biopsia? falošne pozit. serologia? D 1 (IgA def.- ttg IgG), 2 nová vzorka

ž š œ ž š œ The EUROArray system: Principle of DNA microarray analysis tient sample (genomic DNA) G T T C G A C A A A G C T Ÿhybridisation of sample DNA to probes on microarray Ÿdetection of the spots with hybridized PCR-products by measuring fluorescence emission capture DNAoligonucleotide (probes) šstep: amplification and labeling of target DNA target sequence by polymerase chain reaction (PCR) solid phase spot: millions of identical DNA molecules

The EUROArray system

EUROArray HLA-DQ2/DQ8 - Advantage compared to other tests - All 4 relevant HLA alleles are determined by a single microarray incubation:

EUROArray HLA-DQ2/DQ8 - Advantage compared to other tests - Other tests: false positive results possible, e.g. because -subunit of HLA-DQ8 not determined #-subunits of HLA-DQ2 and -DQ8 can not be distinguished ü False positive results! x x => lower diagnostic specificity

-DQA1 alleles Microarray HLA-DQ2/DQ8 Microrray HLA-DQ2/DQ8 unikátne zloženie: -DQB1 alleles

ª ª ª Hodnotenie HLA-DQ2/DQ8 «-DQ2.2 pozitivny pacient HLA-DQ2 DQ8 negativny pacient HLA-DQ2.5 pozitivny pacient «-DQ8 pozitivny pacient «-DQ2.2+2.5 pozitivny pacient

Microarray HLA-DQ2/DQ8 naše skúsenosti

Microarray HLA-DQ2/DQ8 naše skúsenosti

Microarray HLA-DQ2/DQ8 naše skúsenosti!!!nastavenie termocykléra RAMP RATE!!!

Microarray HLA-DQ2/DQ8 naše skúsenosti

HLA-DQ2/DQ8 výsledky august 2012 apríl 2014 1549 pacientov: 1200 1000 600 1099 400 50 45 200 40 Muži Ženy 35 30 25 20 15 10 5 1925 1933 1936 1939 1942 1945 1948 1951 1954 1957 1960 1963 1966 1969 1972 1975 1978 1981 1984 1987 1990 1993 1996 1999 2002 2005 2008 2011

² ± ¹ µ ¹ ¾ à ½ ¾ ½ Ä ¾ ½ à ¾ ½ HLA-DQ2/DQ8 výsledky august 2012 apríl 2014 1549 pacientov: ³-DQ + 645 41.6% HLA-DQ - 901 58.2% not valid 3 0.2% DQ 2 428 66.4% DQ 8 185 28.7% DQ 2 + DQ 8 32 5% 5,00% 0,20% 28,70% 58,20% ¼ ¾½»º  ÁÀ¾½¼»ºvalid Ä

Ñ Ð Î Ï Ë Íä Ë Ì Ê Ç Æ É È Èä Ç Æ Ç Æ É È åä Ç Æ ê Üé çè ÝçÚæ ëìë Þ Ý Óìë Þ Ý Ù ÖÕÔ Ó ß Óìë ëìë Þ Ý í Þ Ý í Þ ß Ý ëìë Þ Ý Þ ß Ý Óìë Þ Ý HLA-DQ2/DQ8 výsledky + HLA-DQ2.2 Åaugust 2012 apríl 2014 1549 pacientov: Ò-DQ + 846 54.6% HLA-DQ - 700 45.2% not valid 3 0.2% DQ 2.2 178 21.60% DQ 2.5 316 38.40% DQ 2.2 + 2.5 112 13.60% DQ 8 172 20.90% Ê32 3.90% 0,20% [HODNOTA] [HODNOTA] 45,20% [HODNOTA] í [HODNOTA] ß Ü ÞÝ ÛÚ ã âàþýüûúvalid [HODNOTA]

ù ø ø ö õ ó ô ò ñ ð ðð ïî ñ ðûúð ñ ððúð HLA-DQ2/DQ8 výsledky DGP pozit. - 2x DQ2.2-110 pac.: ttg+ema+dgp pozit. - 1x (potvrdená celiakia) 120,00% HLA-DQ 2.2.+ 100,00% 97,30% 80,00% 60,00% 40,00% 20,00% 1,80% ttg, EMA, DGP + ttg, EMA, DGP - DGP +

Záver haplotypu HLADQ2.2?

Ďakujem za pozornosť